NadPrep® 通用环化试剂盒 v2 是针对 DNBSEQ™ 技术的 MGI 高通量测序平台开发的文库环化试剂盒。本试剂盒提供的环化模块,同时兼容 MGI 平台单标签 (Single Index,SI) 、MGI 平台双标签 (Dual Index,DI) 和 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) 接头类型文库的环化,并适用于经过 MGIEasy 通用文库转换试剂盒 (App-A) 转换文库的环化,有效精简了单链环状文库制备过程。
本试剂盒中所有试剂均通过质量控制和功能验证,可保证单链环状文库的稳定产出。
● 适用性广:适用多种类型文库环化
● 灵活性强:兼容不同类型文库、插入片段长度和投入量
● 高效环化:环化效率高效稳定
● 流程优化:实验耗时相较于 v1 缩短 1/3
适用性广
图 1. 不同类型接头文库的环化效率和测序质控表现。A. 环化效率,B. Q30 和 C. 比对率。不同类型接头文库采用 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for MGI) 分别搭配 NadPrep® Universal Adapter (SI) Module (for MGI)、NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 构建文库,以 NadPrep® v2、Vendor M*_SI、Vendor M*_DI 和 Vendor M*_Illumina 环化试剂盒进行环化,NadPrep® v2 环化效率表现明显优于竞品。经 MGISEQ-2000,PE 100测序,数据质控方面均有优异表现。
注:样本为人类女性基因组 DNA (Promega-Female, G1521),投入量为 1 pmol;NadPrep® v2: NadPrep® 通用环化试剂盒 v2。
灵活性强
图 2. 不同类型、长度和投入量时的环化表现。A. 不同类型文库,B. 不同长度插入片段和 C. 不同投入量文库的环化效率表现。不同类型样本采用 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for MGI) 分别搭配 NadPrep® Universal Adapter (SI) Module、NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module 和 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI)Module 构建文库,以 NadPrep® v2、NadPrep® v1 和 Vendor M* 环化试剂盒分别进行环化,NadPrep® v2 环化效率表现明显优于 NadPrep® v1 和 Vendor M*,且不同长度插入片段及不同投入量的文库环化效率均比较稳定。
注:NadPrep® v1: NadPrep® 通用环化试剂盒 (for MGI);图 A & B 投入量为 1 pmol,图 B 和图 C 样本分别为 PCR 产物和人类女性基因组 DNA (Promega-Female, G1521) ,图 C 平均插入片段长度为 280 bp。
GC偏好性
图 3. NadPrep® 通用环化试剂盒 v2 对宏基因组样本的环化表现。A. 绿脓杆菌,B. 肠沙门氏菌和 C. 金黄色葡萄球菌。采用 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for MGI) 分别搭配 NadPrep® Universal Adapter (SI) Module (for MGI)、NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI)Module 构建文库,以 NadPrep® v2 和 Vendor M* 环化试剂盒进行环化,无 GC 偏好性。
注:样本为微生物群组 DNA 标准品 (Zymo Research, D6306)。
本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。
通用环化试剂盒
包装 |
管盖颜色 |
组分 |
包装体积 |
Box 1 |
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Universal Splint Buffer II |
390 µL |
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DNA Ligase |
12 µL |
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Digestion Enzyme |
40 µL |
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Stop Solution |
140 µL |
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TE Solution |
1.7 mL |
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Box 2 |
/ |
NadPrep SP Beads |
4 mL |
可能原因 | 解决方案 |
样本存在反应抑制剂 (如 EDTA、高 pH 值等) | 对样本进行纯化后再进行试验 |
试剂保存不当 | 试剂总量较大时,建议分装使用,避免反复冻融 |
不同类型样本文库混合环化后测序数据产出可能存在差异,下图数据仅供参考 。
本试剂盒经优化设计,可兼容 MGI 平台 SI 或 DI 接头类型的文库环化,以及 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) 接头类型文库或经过 MGIEasy 通用文库转换试剂盒(App-A)转换文库的环化。推荐针对不同类型的文库单独进行环化。
类别 |
产品 |
详情 |
货号 |
通用环化模块 |
NadPrep® Universal Circularization Kit v2, 16 rxn |
16 rxn |
1002241 |
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