NanoHema Panel v2.0
#1001721
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产品特色
● 多类型变异覆盖更全面
涵盖 481 个血液肿瘤相关基因，全面解析碱基替换、插入/缺失、扩增及融合基因等多种变异类型。
● 双流程协同结果更准确
RNA 流程有效弥补 DNA 流程的局限，不仅精准识别融合基因伴侣，还能验证融合事件的功能性影响，双流程多维互补保障检测结果的全面性和准确性。
● 个性化定制服务更灵活
支持 Panel 灵活拆分或增加目标基因，精准适配不同类型血液肿瘤的检测需求，满足科研探索或临床诊断的多元场景应用。
产品表现
NanoHema Panel v2.0_DNA——捕获表现
图 1. NanoHema Panel v2.0_DNA 对不同样本的捕获表现。A. 比对率&中靶率；B. 靶区域覆盖度；C. 平均测序深度 (去重后)；D. GC 偏好性。50 ng 不同类型 gDNA 样本利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行预文库构建，以 NanoHema Panel v2.0_DNA 搭配 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获。测序模式分别为 Novaseq 6000，PE150 和 DNBSEQ-T7，PE150；随机选取 1.3 Gb 进行数据分析。
注：LDT-831 样本为血液肿瘤 gDNA 质控品 (LDT Bioscience，LDT-831A：AF = 5%；LDT-831D：AF = 0%)；Male 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)。
NanoHema Panel v2.0_DNA——多类型变异稳定检出
表 1. NanoHema Panel v2.0_DNA 对不同标准品中多类型变异的检出情况。
NanoHema Panel v2.0_RNA——捕获表现
图 2. NanoHema Panel v2.0_RNA 捕获测序数据组成。50 ng K562 细胞系 RNA 以 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA Library Preparation Kit v2 进行预文库构建，以 NanoHema Panel v2.0_RNA 搭配 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获。测序模式分别为 Novaseq 6000，PE150 (A) 和 DNBSEQT7， PE150 (B)。以 Salmon 进行分析。
NanoHema Panel v2.0_RNA——融合基因检出情况
表 2. NanoHema Panel v2.0_RNA 对 K562 细胞系 RNA 中融合基因的检出。
注：每百万 read pair。测序数据以 Arriba 进行分析。
基因列表
|
NanoHema Panel v2.0_DNA_436 genes_Full CDS |
||||||||||||||
| ABL1 | ABL2 | ACTB | AKT1 | AKT2 | AKT3 | ALK | AMER1 | ANKRD26 | AP3B1 | APC | AR | ARAF | ARHGAP26 | ARID1A |
| ARID1B | ARID2 | ARID5B | ASXL1 | ASXL2 | ASXL3 | ATG5 | ATM | ATR | ATRX | ATXN1 | AURKA | AURKB | AXIN1 | AXL |
| B2M | BAALC | BAP1 | BARD1 | BCL10 | BCL11A | BCL11B | BCL2 | BCL6 | BCL7A | BCOR | BCORL1 | BIRC3 | BLM | BLNK |
| BRAF | BRCA1 | BRCA2 | BRD4 | BTG1 | BTG2 | BTK | BTLA | CALR | CARD11 | CBFB | CBL | CBLB | CCND1 | CCND2 |
| CCND3 | CCNE1 | CCR4 | CCR7 | CCT6B | CD22 | CD27 | CD274 | CD28 | CD58 | CD70 | CD79A | CD79B | CD83 | CDC42 |
| CDC73 | CDH1 | CDK12 | CDK4 | CDK6 | CDK8 | CDKN1A | CDKN1B | CDKN1C | CDKN2A | CDKN2B | CDKN2C | CEBPA | CEP57 | CHD2 |
| CHD8 | CHEK1 | CHEK2 | CIITA | CKS1B | CREBBP | CRLF2 | CSF1R | CSF3R | CTCF | CTLA4 | CTNNB1 | CUX1 | CXCR4 | CYLD |
| DAXX | DDR2 | DDX3X | DDX41 | DHX15 | DNM2 | DNMT3A | DOT1L | DTX1 | DUSP2 | DUSP22 | EBF1 | ECT2L | EED | EGFR |
| EP300 | EPCAM | EPHA2 | EPHA3 | EPHA5 | EPHA7 | EPOR | ERBB2 | ERBB3 | ERBB4 | ERCC4 | ERG | ESR1 | ETNK1 | ETS1 |
| ETV1 | ETV4 | ETV6 | EZH2 | FAM46C | FANCA | FANCC | FANCD2 | FANCE | FANCF | FANCG | FANCI | FANCJ | FANCL | FANCM |
| FAS | FAT1 | FAT4 | FBXO11 | FBXW7 | FGFR1 | FGFR2 | FGFR3 | FGFR4 | FH | FLCN | FLT1 | FLT3 | FLT4 | FOXO1 |
| FOXO3 | FOXP1 | FYN | GADD45B | GATA1 | GATA2 | GATA3 | GNA11 | GNA13 | GNAQ | GNAS | GNB1 | GRIN2A | HACE1 | HBA1 |
| HBA2 | HBB | HDAC1 | HDAC4 | HDAC7 | HGF | HIST1H1A | HIST1H1C | HIST1H1D | HIST1H1E | HNF1A | HRAS | ID3 | IDH1 | IDH2 |
| IFNAR2 | IGF1R | IGH | IGK | IGL | IGLL5 | IKBKE | IKZF1 | IKZF2 | IKZF3 | IL3 | IL7R | INPP4B | INPP5D | IRF1 |
| IRF4 | IRF8 | ITK | ITPKB | JAK1 | JAK2 | JAK3 | JARID2 | JUN | KAT6A | KDM2B | KDM5A | KDM5C | KDM6A | KDR |
| KIT | KLF2 | KLHL5 | KLHL6 | KMT2A | KMT2B | KMT2C | KMT2D | KRAS | LEF1 | LMO2 | LRP1B | LTB | LYN | LYST |
| MAF | MAFB | MALT1 | MAP2K1 | MAP2K2 | MAP2K4 | MAP3K1 | MAP3K14 | MAPK1 | MCL1 | MDM2 | MDM4 | MED12 | MEF2B | MEF2D |
| MEN1 | MET | MFHAS1 | MGA | MITF | MLH1 | MPL | MSH2 | MSH3 | MSH6 | MTOR | MUTYH | MYB | MYC | MYCL |
| MYCN | MYD88 | NBN | NCKAP1L | NCSTN | NF1 | NF2 | NFE2L2 | NFKB1 | NFKB2 | NFKBIA | NFKBIE | NKX2-1 | NLRC4 | NOTCH1 |
| NOTCH2 | NPM1 | NRAS | NSD1 | NT5C2 | NTRK1 | NTRK3 | NUP98 | P2RY8 | PAG1 | PAK3 | PALB2 | PAX5 | PBRM1 | PC |
| PDCD1 | PDCD1LG2 | PDGFRA | PDGFRB | PDK1 | PHF6 | PIK3CA | PIK3CD | PIK3R1 | PIK3R2 | PIM1 | PLCG1 | PLCG2 | PML | PMS2 |
| POLE | POT1 | POU2AF1 | PPM1D | PPP2R1A | PRDM1 | PRF1 | PRKCB | PRPF8 | PTCH1 | PTEN | PTPN1 | PTPN11 | PTPN2 | PTPN6 |
| PTPRD | PTPRK | PTPRO | RAB27A | RAD21 | RAD50 | RAD51 | RAF1 | RARA | RASGEF1A | RB1 | RECQL4 | REL | RELN | RET |
| RHOA | RICTOR | RNF43 | ROS1 | RPL10 | RPS15 | RPTOR | RUNX1 | SAMD9 | SAMD9L | SBDS | SDHA | SDHB | SDHC | SDHD |
| SETBP1 | SETD2 | SF3B1 | SGK1 | SH2B3 | SH2D1A | SLC19A1 | SLC7A7 | SMAD2 | SMAD4 | SMARCA2 | SMARCA4 | SMARCB1 | SMC1A | SMC3 |
| SMO | SOCS1 | SOX11 | SOX2 | SPEN | SPOP | SRC | SRP72 | SRSF2 | STAG2 | STAT3 | STAT4 | STAT5A | STAT5B | STAT6 |
| STK11 | STX11 | STXBP2 | SUFU | SUZ12 | SYK | TBL1XR1 | TCF3 | TCL1A | TERC | TERT | TET1 | TET2 | TET3 | TGFBR2 |
| TNFAIP3 | TNFRSF11A | TNFRSF14 | TNFRSF17 | TNFRSF1B | TOP1 | TOP2A | TP53 | TP63 | TP73 | TRAF2 | TRAF3 | TRAF5 | TSC1 | TSC2 |
| TSHR | TYK2 | U2AF1 | UNC13D | VAV1 | VHL | WHSC1 | WT1 | XIAP | XPC | XPO1 | ZAP70 | ZBTB7A | ZEB2 | ZMYM3 |
| ZRSR2 | ||||||||||||||
| NanoHema Panel v2.0_DNA_12 genes_Selected Intron | ||||||||||||||
| ALK | BCL6 | BCR | BRAF | ETV6 | JAK2 | KMT2A | MYC | PDGFRA | PDGFRB | RARA | RET | |||
| NanoHema Panel v2.0_RNA_146 genes | ||||||||||||||
| ABL1 | ABL2 | ALK | ARHGAP26 | ARID1A | ASXL1 | ATG5 | BCL10 | BCL11A | BCL11B | BCL2 | BCL3 | BCL6 | BCL7A | BCL9 |
| BCOR | BCR | BIRC3 | BRAF | BTG1 | CBFA2T3 | CBFB | CBL | CCND1 | CCND2 | CCND3 | CD274 | CDK6 | CEBPE | CIITA |
| CREBBP | CRLF2 | CTNNB1 | DEK | DUSP22 | DUX4 | EGFR | EP300 | EPOR | ERBB2 | ERG | ETS1 | ETV1 | ETV4 | ETV6 |
| EWSR1 | FGFR1 | FGFR2 | FGFR3 | FOXO1 | FOXO3 | FOXP1 | GLIS2 | HLF | IGH | IGK | IGL | IKZF1 | IL3 | IRF4 |
| ITK | JAK1 | JAK2 | JAK3 | KAT6A | KIF5B | KMT2A | LMO1 | LMO2 | LYN | MAF | MAFB | MALT1 | MECOM | MEF2D |
| MLLT1 | MLLT10 | MLLT3 | MN1 | MTCP1 | MYB | MYC | MYH11 | NCOA2 | NCOR1 | NF1 | NF2 | NFKB2 | NOTCH1 | NPM1 |
| NSD1 | NTRK1 | NTRK3 | NUP214 | NUP98 | NUTM1 | P2RY8 | PAX5 | PBX1 | PDCD1LG2 | PDGFRA | PDGFRB | PICALM | PIM1 | PML |
| POU2AF1 | PRDM1 | PTCH1 | RAF1 | RARA | RARB | RARG | RBM15 | RET | ROS1 | RUNX1 | RUNX1T1 | STAT6 | STIL | SYK |
| TAF15 | TAL1 | TBL1XR1 | TCF3 | TCL1A | TCL1B | TET1 | TLX1 | TLX3 | TNFRSF11A | TOP1 | TP63 | TPM3 | TPM4 | TRA |
| TRB | TRD | TRG | TYK2 | VAV1 | WHSC1 | ZBTB16 | ZEB2 | ZNF292 | ZNF362 | ZNF384 | ||||
| 包装编号 | 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1001721 (96 rxn) |
包装体积 1001722 (16 rxn) |
| Box 1 |
|
NanoHema Panel v2.0_DNA | 415 μL | 70 μL |
|
|
NanoHema Panel v2.0_RNA | 415 μL | 70 μL |
首先，RNA-seq 需要去除 rRNA，且这要求每个样本进行单独的反应，增加了实验的复杂性及成本。其次，RNA-seq 在灵敏度上相对较低，特别难以检测低频融合事件，尤其是在低表达样本中。
目前推出的 NanoHema Panel v2.0 一款全面的大型 Panel，涵盖了广泛的血液肿瘤相关基因变异。为了适应不同临床场景的需求，该 Panel 支持多种定制选项，包括：
(1) 灵活拆分为多个子 panel，如：急性髓系白血病 (AML)、淋巴细胞白血病、T 细胞淋巴瘤和 B 细胞淋巴瘤；
(2) 根据具体研究或诊断需求，增加其他感兴趣的基因，以满足个性化检测的要求。
| 产品名称 | 货号 |
| NanoHema Panel v2.0, 96 rxn | 1001721 |
| NanoHema Panel v2.0, 16 rxn | 1001722 |
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