NadPrep®️ rRNA 快速封阻模块 - Library Preparation - 纳昂达

产品特色

简便快捷

一步移液操作直接将 rRNA Blocking Reagent 与反应体系混合

快速高效

8 min 即可高效封阻 rRNA
有效富集低丰度 RNA
增强有效信息，降低测序成本

灵活兼容

兼容不同质量的 RNA 样本
支持 50-500 ng RNA 样本投入
兼容第三方 RNA 文库构建试剂盒
灵活定制化拓展至其它物种或其他区域

方案流程

方案表现

兼容多样本类型的不同投入量

图 1. NadPrep^® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Human) 应用于不同样本类型不同投入量时的表现。A. rRNA 占比；B. 基因检出个数；C. 转录本覆盖。利用 NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Human) 搭配 NadPrep^® 总 RNA 逆转录模块衔接 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒进行文库构建，Illumina^® Novaseq 6000, PE150 测序，每个样本随机选取 0.3 Gb 用于数据分析。
注：Cell line 为 Human Brain Total RNA (Takara, 636530)；FFPE A：DV 200 = 69%； FFPE B：DV 200 = 32%。

图 2. NadPrep^® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Zebrafish) 应用于不同投入量斑马鱼总 RNA 时的表现。A. rRNA 占比；B. 基因检出个数；C. 转录本覆盖。利用 NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish) 搭配 NadPrep^® 总 RNA 逆转录模块衔接 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒进行文库构建。

兼容不同质量等级的FFPE样本

图 3. NadPrep^® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Human) 应用于不同质量等级 FFPE 样本时的表现。A. rRNA 占比；B. 基因检出个数；C. 转录本覆盖。
注：来源于 250 ng FFPE 样本，DV 200 分别为 72%、 69%、 61%、 57%、 48%、 32%。

兼容第三方 RNA 建库试剂盒

图 4. NadPrep^® rRNA 快速封阻全流程解决方案衔接第三方 RNA 文库构建试剂盒应用效果。A. rRNA 占比；B. 基因检出个数；C. 转录本覆盖；D. 表达谱相关性。250 ng 细胞系 K562 RNA 投入，利用 NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Human) 分别搭配 NadPrep^® 总 RNA 逆转录模块衔接 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒，KAPA 及 NEB RNA 文库构建试剂盒进行文库构建。50 ng 斑马鱼总 RNA 投入，利用 NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish) 分别搭配 NadPrep^® 总 RNA 逆转录模块衔接 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒，Yeasen 及 ABclonal RNA 文库构建试剂盒进行文库构建。
注：H：Human；Z：Zebrafish。

兼容双测序平台

图 5. NadPrep^® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Human) 在双测序平台的性能表现。A. rRNA 占比；B. 基因检出个数。250 ng 投入，利用 NadPrep^® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Human) 衔接 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒分别搭配 NadPrep^® Universal Adapter (MDI) Module 和 NadPrep^® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行文库构建，DNBSEQ-T7, PE150 和 Illumina^® Novaseq 6000, PE150 测序。

竞品比较

图 6. NadPrep^® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Human) 与竞品性能比较。A. rRNA 占比；B. 基因检出个数；C. 转录本覆盖；D. 表达谱相关性。250 ng 投入，分别利用 NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Human)、Vendor A 和 Vendor B 搭配 NadPrep^® 总 RNA 逆转录模块进行文库构建。
注：Vendor A：快速去除法；Vendor B：RNase H 酶法。C&D 仅以 Cell line (K562 RNA) 展示。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

RNA-To-DNA 模块

包装编号	管盖颜色	组分名称	包装体积 1002401 (24 rxn)	包装体积 1002402 (96 rxn)
Box1		1^st Strand Synth. Buffer	120 µL	460 µL
		Random Primer	30 µL	115 µL
		1^st Strand Synth. Enzyme	60 µL	230 µL
		2^nd Strand Synth. Buffer	810 µL	2×1550 µL
		2^nd Strand Synth. Enzyme	90 µL	345 µL
	/	Nuclease Free Water	2.5 mL	8 mL
Box2	/	NadPrep SP Beads	2.5 mL	10 mL

rRNA 快速封阻模块 · NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Human)

管盖颜色	组分名称	包装体积 1002901 (24 rxn)	包装体积 1002902 (96 rxn)
	rRNA Blocking Reagent (Human)	30 µL	115 µL

rRNA 快速封阻模块 · NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish)

管盖颜色	组分名称	包装体积 1002911 (24 rxn)	包装体积 1002912 (96 rxn)
	rRNA Blocking Reagent (Zebrafish)	30 µL	115 µL

NadPrep® rRNA 快速封阻全流程解决方案是否适用于降解严重的 FFPE 样本？

该方案适用于绝大部分不同等级的细胞、组织来源的 RNA，但降解严重的 FFPE 样本 (DV 200 < 20%) rRNA 则不推荐使用。

NadPrep® rRNA 快速封阻全流程解决方案是否可兼容其他第三方 RNA 文库构建试剂盒？

可以。该方案衔接 RNA 文库构建试剂盒用于总 RNA 测序 (RNA-Seq) 的文库制备。若选择第三方 RNA 文库构建试剂盒，则推荐使用 NEBNext® Ultra™ II RNA Library Prep Kit for Illumina® (NEB，Cat # E7770L)、KAPA RNA HyperPrep Kit (Roche，Cat # KK8541) 。使用其他品牌 RNA 建库试剂盒请咨询纳昂达技术支持。

使用 NadPrep® rRNA 快速封阻全流程方案制备的双链 DNA 产物产量为什么偏高？

该产品中含有大量的 rRNA ssDNA 封阻试剂，搭配使用 NadPrep® 总 RNA 反转模块得到的双链 DNA 纯化产物中会产生少许 ssDNA 残留。使用核酸荧光定量仪对双链 DNA 进行定量时，残留的 ssDNA 会影响双链 DNA 结果，导致产量偏高，但残留的 rRNA ssDNA 封阻试剂不会影响后续文库构建等分子生物学实验。

类别	产品	详情	货号
rRNA 快速封阻模块	NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Human), 24 rxn	24 rxn	1002901
	NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Human), 96 rxn	96 rxn	1002902
	NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish), 24 rxn	24 rxn	1002911
	NadPrep^® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish), 96 rxn	96 rxn	1002912
反转录模块	Nadprep^® Total RNA-To-DNA Module, 24 rxn	24 rxn	1002401
反转录模块	Nadprep^® Total RNA-To-DNA Module, 96 rxn	96 rxn	1002402

NadPrep^®️ rRNA 快速封阻模块

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