总 RNA 逆转录模块兼容多种类型样本,包括细胞、组织、FFPE 样本等。对于复杂样本的处理(如 FFPE 组织样本),推荐从源质控。样本应选取合适的提取试剂盒,并进行相应的定量及片段质检,建议如下:
类别 |
要求 |
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提取试剂盒推荐 |
细胞系 RNA |
AllPrep DNA/RNA Mini Kit(Qiagen;货号,80204) |
FFPE RNA |
AllPrep DNA/RNA FFPE Kit(Qiagen;货号,80234) |
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定量 |
基于分光光度计原理的 NanoDrop 和基于荧光染料的 Qubit®RNA HS Assay定量 |
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纯度 |
OD260/OD280=1.7~2.0。OD260/OD280 > 2.0 表明有异硫氰酸污染,< 1.7 表明有蛋白质等污染 |
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完整性 |
定量法 |
RNA IQ(By Qubit™ RNA IQ Assay Kit)>4 RIN(ByAgilent 2100)>3 DV200(By Agilent 2100;>200 nt RNA所占比例)>50 % |
条带检测法 |
2% 的琼脂糖凝胶电泳或生物分析仪,如 Agilent 2100、Bioptic(Qsep)进行样本完整性评估。 |