NEX-t Panel v1.0 在探针设计层面具有哪些优势，如何平衡捕获性能与经济成本？
浏览量：195 / 发布时间：2023-09-08
- 一般来说，对病原微生物基因组进行完整的探针覆盖是无法实现的。一方面是由于在考虑参考基因组以外的序列多态性时，一种细菌所需的探针即可达数十万条；另一方面是由于当病原序列与宿主序列存在一定相似性时，为防止脱靶，需要舍弃这些区域。因此，NEX-t Panel v1.0 在探针设计时侧重于以最少的探针实现最多的病原分析功能，panel 规模相比于常见的杂交捕获 tNGS 方案大为精简。
- 探针条数可近似等效于多重扩增子的扩增子个数，但由于探针具有更高的容错性，同时还能捕获到探针侧翼的序列；因此，一定数量的探针可获得比相似扩增子个数的多重扩增更丰富的信息。
- 与多重扩增子相比，杂交捕获 Panel 的扩展更为简单，只需增加探针。因此，NEX-t Panel v1.0 可以方便地进行定制和组合升级。
