真实世界新冠变异毒株追踪检测
图1. SARS-CoV-2 基因组结构示意图
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图2. A. μCaler 探针设计原理；B. 杂交捕获全流程仅 2.5 小时。
我们近期推出的 μCaler® SARS-CoV-2 Panel ，旨在提供一套简单快速且覆盖均一性优异的 SARS-CoV-2 全基因测序方案。这款 Panel 依据新冠参考基因组原始株设计，能够覆盖新冠病毒 29.9 Kb 全基因组区域，在此基础上格外加强了新冠疫苗 S 突刺蛋白、RNA 聚合酶核蛋白等高频突变区域的捕获能力，这些区域的基因变异特征对疫苗开发格外重要。
μCaler ——新冠变异病毒全基因组解决方案介绍
测试一：SARS-Cov-2 细胞传代毒 (Omicron BA.1.1) 检测
图3. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对细胞传代新冠变异毒株 (Omicron BA.1.1) 的捕获表现及病毒全基因组的覆盖度。RNA 样本利用 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina®) 建库, 并以 μCaler® SARS-CoV-2 Panel 搭配 μCaler® Hybrid Capture Reagents 和 μCaler® NanoBlockers (for Illumina®) 组成完整的杂交捕获方案，测序模式：MiniSeq SE 100，测序数据以 IRMA 分析。A. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对细胞系新冠变异毒株的基础捕获表现；B. 新冠病毒全基因组覆盖度。
测试二：真实世界临床样本 SARS-Cov-2 全基因组捕获测序
图4. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对口咽拭子样本的捕获表现及病毒全基因组的覆盖度。RNA 样本利用NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina®) 建库, 并以 μCaler® SARS-CoV-2 Panel 搭配 μCaler® Hybrid Capture Reagents 和 μCaler® NanoBlockers (for Illumina®) 组成完整的杂交捕获方案，测序模式：MiniSeq PE 150，测序数据以 IRMA 分析。A. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对口咽拭子样本的基础捕获表现；B. 新冠病毒全基因组覆盖度。
解决方案
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分类 |
产品名称 |
货号 |
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反转录模块 |
NadPrep® Total RNA-To-DNA Module, 24 rxn |
1002401 |
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NadPrep® Total RNA-To-DNA Module, 96 rxn |
1002402 |
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建库模块 |
NadPrep® DNA Library Preparation Kit (for Illumina®) G24 |
1002101 |
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NadPrep® DNA Library Preparation Kit (for Illumina®) E96 |
1002103 |
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接头模块 |
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn |
1003240 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn |
1003241 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn |
1003242 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn |
1003251 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn |
1003252 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn |
1003253 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn |
1003254 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn |
1003261 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F2, 1152 rxn |
1003262 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F3, 1152 rxn |
1003263 |
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NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F4, 1152 rxn |
1003264 |
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封阻序列 |
μCaler® NanoBlockers (for Illumina®), 16 rxn |
1106102 |
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μCaler® NanoBlockers (for Illumina®), 96 rxn |
1106101 |
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杂交试剂 |
μCaler® Hybrid Capture Reagents, 16 rxn |
1105102 |
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μCaler® Hybrid Capture Reagents, 96 rxn |
1105101 |
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Panel |
μCaler® SARS-CoV-2 Panel, 16 rxn |
1101302 |
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μCaler® SARS-CoV-2 Panel, 96 rxn |
1101301 |
*文中所有数据，均由客户友情提供。
关于纳昂达科技
http://www.njnad.com/
纳昂达科技秉承“ Nano Trans More ”的核心理念和“靶向精准，用心服务诊断”的奋斗宗旨，致力于为科研院校、医疗机构、临检单位、产业公司、测序服务商等提供专业化和高质量的靶向测序产品与闭环解决方案。
纳昂达科技已通过高新技术企业、江苏省科技型中小企业和南京市精准高通量测序工程技术研究中心认定，并拥有 > 2,000 平米的高通量测序研发中心和 > 4,000 平米的GMP级别 (YY/T 0287-2017 idt ISO 13485:2016) 体外诊断试剂生产基地，建立了从市场调研、产品设计、生产制造到售后服务完整的质量管理体系。
纳昂达专注于精准靶向试剂和配套自动化仪器的开发、生产、销售和服务，目前拥有 MGI 和 Illumina 双测序平台多款 NadPrepⓇ 文库构建试剂盒和全套液相杂交相关产品。明星产品包括 NGS 全流程自动化工作站、肿瘤全外显子 Panel、泛实体瘤和血液肿瘤 Panel 以及呼吸道病毒 Panel 等，并提供全面完善的双平台捕获探针定制化服务。纳昂达科技的靶向捕获产品拥有与国际同行业媲美的高质量水准，获得了客户一致的信赖。
纳昂达的销售网络覆盖全国并已外延至海外地区。纳昂达将与客户共成长，对客户的需求全力以赴，为全球用户提供靶向测序解决方案和 IVD 试剂原料。
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电话：400 871 7699
邮箱：sales@njnad.com
网址：www.njnad.com
参考文献
[1] Chen L, Liu W, Zhang Q, et al. RNA based mNGS approach identifies a novel human coronavirus from two individual pneumonia cases in 2019 Wuhan outbreak[J]. Emerging microbes & infections, 2020, 9(1): 313-319.
[2] Qasem A, Shaw A M, Elkamel E, et al. Coronavirus disease 2019 (COVID-19) diagnostic tools: a focus on detection technologies and limitations[J]. Current issues in molecular biology, 2021, 43(2): 728-748.
