NadPrep® 快速 RNA & DNA 共建库模块
#1002452
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产品特色
● 灵活兼容 · 一步共检
支持 1-200 ng RNA 和/或 1-200 ng DNA 不同比例混合核酸样本同步建库
适配 NovaSeq、DNBSEQ 等主流高通量测序平台，具备良好的自动化兼容性
● 一管到底 · 快速建库
预混即用型设计结合单管式操作，减少体系配制与移液步骤，简化实验流程
优化建库流程，无需二链 cDNA 合成和连接产物纯化环节，总耗时仅约 3 hr
● 高效产出 · 均一稳定
稳定高效的文库产出 优化的酶学体系与反应条件，确保文库产出稳定高效
片段分布均一，低 GC 偏好降低覆盖偏倚，结果稳定可靠
● 超高灵敏 · 精准检出
针对低起始投入量及低丰度病原体样本优化，扩大起始模板投入空间
有效提升低载量病原体的检出能力，减少样本损耗，降低漏检风险
● 严控背景 · 结果可靠
ISO 13485 专项生产线全方位严控背景菌残留，降低假阳性风险
建立覆盖全流程的背景微生物库并实行动态更新，排除外源微生物
实验流程
产品表现
灵活兼容 · 高效稳定
图 1. NadPrep® 快速 RNA & DNA 共建库试剂盒对不同投入量 RNA & DNA 混合样本的建库表现。利用 NadPrep® EZ RNA & DNA Library Co-Preparation Module 分别搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Adapter (NovaSeq) 和 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) (DNBSEQ) 进行文库构建。A. 文库产出；B. 文库片段分布 (NovaSeq)。
注：RNA 样本为 Jurkat 细胞系 RNA；DNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1521)。
严控背景 · 结果可靠
表 1. 基于本地自建背景微生物库评估 NadPrep® 快速 RNA & DNA 共建库试剂盒中的背景菌残留。
利用 NadPrep® 快速 RNA & DNA 共建库试剂盒对拟宿主混合核酸样本构建宏基因组文库。拟宿主混合核酸样本为 Human Brain Total RNA 标准品 (Clontech, 636530) 和人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1521) 以 50 ng:50 ng 进行混合。测序模式为 NovaSeq 6000，PE150。每个样本的平均测序量为 5 M reads pair。
超高灵敏 · 精准检出
表 2. 两种共建库试剂盒对不同浓度梯度标准品中病原体的检出能力比较。
取 400 μL 不同浓度梯度的标准品用于 DNA 提取，分别利用 NadPrep® RNA & DNA 共建库试剂盒 (Co-Prep) 和 NadPrep® 快速 RNA & DNA 共建库试剂盒 (EZ Co-Prep) 进行预文库构建，50% 预文库投入杂交，以 μCaler® HyperMix Hybrid Capture Kit (for Illumina®) 和 μCaler® RIA Panel v1.0 完成杂交捕获。测序模式为 NovaSeq 6000，PE150。每个样本 0.5 Gb 用于数据分析。
图 2. NadPrep® 快速 RNA & DNA 共建库试剂盒对不同浓度梯度标准品中检出病原体的 RPM 与浓度呈现良好的线性关系。
注：RPM 为每百万映射的 read 数，以 unique reads 计算 RPM。
临床真实样本应用示例
图 3. 两种共建库试剂盒对呼吸道混合感染者口咽拭子样本的建库表现和病原体的检出能力。 取 400 μL 拭子保存液，提取 RNA & DNA 混合核酸，分别利用两种共建库试剂盒进行预文库构建，50% 预文库投入杂交，以 μCaler® HyperMix Hybrid Capture Kit (for Illumina®) 和 μCaler® RIA Panel v1.0 完成杂交捕获。A. 预文库产出；B. 检出病原体的 RPM。
表 3. NadPrep® 快速 RNA & DNA 共建库试剂盒对 HIV 感染者血液样本的建库表现及 HIV-1 全基因组序列解析能力。
取适量血液样本用于 RNA 提取，利用 NadPrep® 快速 RNA & DNA 共建库试剂盒进行预文库构建，50% 预文库投入杂交，以 μCaler® HyperMix Hybrid Capture Kit (for Illumina®) 和 μCaler® HIV-1 Panel 完成杂交捕获。
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
建库模块
| 包装编号 | 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1002451 (24 rxn) |
包装体积 1002452 (96 rxn) |
| Box1 |
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Co-Random Primer | 90 µL | 350 µL |
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cDNA Synth. Mix | 435 µL | 2×875 µL | |
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Co-FERA Mix | 250 µL | 980 µL | |
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Co-Ligation Mix | 600 µL | 2×1,200 µL | |
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2X HiFi PCR Master Pro Mix | 1,300 µL | 4×1,300 µL | |
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PCR Enhancer (for Illumina®) | 150 µL | 575 µL | |
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PCR Enhancer (for MGI, DI) | 150 µL | 575 µL | |
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/ |
Nuclease Free Water | 2.5 mL | 8 mL | |
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TE Solution | 1 mL | 4 mL | |
| Box2 |
/ |
NadPrep SP Beads | 4 mL | 15 mL |
通用截短型双端唯一接头模块
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003240 (24 rxn) |
包装体积 1003241 (96 rxn) |
包装体积 1003242 (96 rxn) |
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NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
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NadPrep Universal Stubby Adapter | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
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NadPrep Amplification Primer Mix II | 20 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
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NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
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NadPrep Universal Stubby Adapter | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
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NadPrep Amplification Primer Mix II | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
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NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
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NadPrep Universal Stubby Adapter | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
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NadPrep Amplification Primer Mix II | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
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NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL(Tube) | 96×72 µL (Tube) |
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NadPrep Universal Stubby Adapter | 2×1,350 µL (Tube) | 2×1,350 µL (Tube) | 2×1,350 µL (Tube) | 2×1,350 µL (Tube) |
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NadPrep Amplification Primer Mix II | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) |
双端唯一接头模块 (for MGI)
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003711 (24 rxn) |
包装体积 1003721 (96 rxn) |
包装体积 1003722 (96 rxn) |
包装体积 1003725 (96 rxn) |
包装体积 1003726 (96 rxn) |
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|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
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|
NadPrep M-Adapter (DI) | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
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|
NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 20 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
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NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
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NadPrep M-Adapter (DI) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
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NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
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NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
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NadPrep M-Adapter (DI) | 2×1,350 µL (Tube) | 2×1,350 µL (Tube) | 2×1,350 µL (Tube) | 2×1,350 µL (Tube) |
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NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL >(Tube) |
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
主要通过以下几个方面实现：
• 优化酶学反应，精简操作流程：通过对关键酶原料、体系配制及反应条件进行系统性优化，在省略二链 cDNA 合成步骤的同时，实现 RNA & DNA 杂合连和双链 DNA 的同步片段化、末端修复 & 加 A 处理，有效减少操作步骤，加快实验进程。
• 降低非目标干扰，提升扩增效率：采用优化的扩增体系设计，结合 PCR Enhancer 有效降低接头二聚体及非特异性扩增产物的形成，提高目标文库富集效率，从而省去连接产物纯化步骤，进一步缩短实验时间。
• 提升样本兼容性，增强适配能力：针对混合感染或低载量/低丰度病原体样本进行专项优化，支持更大的模板投入空间，在保证文库产出稳定性和一致性的同时，进一步提升病原体的检出能力。
• 投入量过低：若核酸样本总投入量极低 (< 1 ng)，文库产出偏低属正常现象，可继续进行后续实验。
• RNase 污染：实验全程应使用 RNase-free 耗材并在无 RNase 污染的环境下操作，否则会影响反转录效率，导致文库产出偏低。
• 样本纯度低：若核酸样本中残留过多的螯合剂、胍盐、苯酚、蛋白质、乙醇等杂质，会抑制反转录酶活性及 DNA 酶切效率。建议按照使用说明书步骤七：扩增产物纯化使用 2X NadPrep® SP Beads 对核酸样本进行纯化，注意替换洗脱试剂为 Nuclease Free Water。
• 样本质量差：对于质量较差的核酸样本，建议按照使用说明书推荐适当增加 PCR 扩增循环数。
• 文库过度扩增：PCR 扩增后期，引物通常早于 dNTP 耗尽，过多循环会导致非特异性扩增产物的积累。这类产物在电泳检测中迁移速率较慢，表现为高分子量区域的弥散条带，但这些产物仍可与 Flow Cell 结合并正常测序，对测序结果影响不大。
• 样本纯度低：若核酸样本中存在高浓度 EDTA 或偏高的 pH，会抑制 DNA 酶切效率，导致片段化不充分。建议按照使用说明书步骤七：扩增产物纯化使用 2X NadPrep® SP Beads 对核酸样本进行纯化，注意替换洗脱试剂为 Nuclease Free Water。
• 投入量低：当核酸样本总投入量低于 5 ng 时，文库制备过程中易形成接头二聚体，导致文库中小片段比例偏高且无明显主峰。针对此情况，建议根据下游应用场景分别处理：
I. 宏基因组测序 (mNGS)：当核酸样本总投入量在 100 pg-5 ng 时，建议按照使用说明书步骤七：扩增产物纯化使用 0.8X NadPrep® SP Beads 对终文库进行纯化后再进行上机测序。
II. 靶向捕获测序 (tNGS)：直接进入液相杂交靶向捕获流程。
| 类别 | 产品名称 | 规格 | 货号 |
| 建库模块 | NadPrep® EZ RNA & DNA Library Co-Preparation Module v2, 24 rxn | 24 rxn | 1002451 |
| NadPrep® EZ RNA & DNA Library Co-Preparation Module v2, 96 rxn | 96 rxn | 1002452 | |
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通用截短型双端唯一 接头模块 |
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn | Index 1-12 | 1003240 |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn | Index 1-24 | 1003241 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn | Index 25-48 | 1003242 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn | Index 1-96 | 1003251 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn | Index 97-192 | 1003252 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn | Index 193-288 | 1003253 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn | Index 289-384 | 1003254 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E5 , 96 rxn | Index 385-480 | 1003255 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E6 , 96 rxn | Index 481-576 | 1003256 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E7 , 96 rxn | Index 577-672 | 1003257 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E8 , 96 rxn | Index 673-768 | 1003258 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn | Index 1-96 | 1003261 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F2, 1152 rxn | Index 97-192 | 1003262 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F3, 1152 rxn | Index 193-288 | 1003263 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F4, 1152 rxn | Index 289-384 | 1003264 | |
| 双端唯一接头模块 (for MGI) | NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | MDI 1-12 | 1003711 |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-24 | 1003721 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | MDI 25-48 | 1003722 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn | MDI 49-72 | 1003725 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn | MDI 73-96 | 1003726 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-96 | 1003751 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E2 (for MGI), 96 rxn | MDI 97-192 | 1003752 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E3 (for MGI), 96 rxn | MDI 193-288 | 1003753 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E4 (for MGI), 96 rxn | MDI 289-384 | 1003754 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F1 (for MGI), 1152 rxn | MDI 1-96 | 1003761 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F2 (for MGI), 1152 rxn | MDI 97-192 | 1003762 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F3 (for MGI), 1152 rxn | MDI 193-288 | 1003763 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F4 (for MGI), 1152 rxn | MDI 289-384 | 1003764 |
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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