μCaler® FS EMS+ Panel v1.0

产品特色

• 样本兼容：广泛适用于 gDNA、cfDNA 及不同等级的 FFPE DNA 样本。
• 多癌检测：一次性覆盖全球 10 大高发癌种具有重要意义的 CpG 位点。
• 灵活定制：可针对单癌种或多癌种，定制不同规模 CpG 位点和或基因突变的探针包。
• 精准定量：支持不同甲基化状态 (0% ~ 100%) 样本实现准确且稳定的甲基化水平定量。
• 高效捕获：无需序列转化，充分保留原始序列丰富度，数倍提高有效覆盖深度。
• 超高灵敏：支持搭配双端唯一分子标签接头实现对低至极低丰度信号的超高灵敏度检测。
  

产品表现

精准定量甲基化水平

图 1. μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 对不同甲基化水平的模拟样本精准定量。A. 理论甲基化水平与实际检测到的甲基化水平的比较；B. 靶区域 CpG 位点的甲基化水平。模拟样本利用 μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案和 μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 完成杂交捕获，测序模式分别为 DNBSEQ-T7，PE150 和 NovaSeq 6000，PE150。随机选取 1 M reads pair 进行数据分析。

注：甲基化阳性对照 100% Methylated DNA (zymo, D5014-2) 和阴性对照 0% Methylated DNA (zymo, D5014-1)，经不同比例混合以模拟不同甲基化水平 (0%，10%，50% 和 100%)，样本起始投入量为 50 ng。

保持甲基化检测的高稳定性

图 2. μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 对同一样本两次重复之间检出甲基化水平的相关性分析。A-D. 4 例独立样本两次重复检测的甲基化水平相关性。随机选取 4 例临床肿瘤组织样本 (A & B 为结直肠癌，C & D 为膀胱癌) 利用 μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案和 μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 完成杂交捕获。相关性检测结果中 R² 分布范围为 0.9279 ~ 0.9707。
注：样本起始投入量为 20 ng。

有效区分肿瘤和癌旁组织

图 3. μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 应用于临床结直肠癌及其癌旁组织时的甲基化水平检出情况。A. 结直肠癌配对样本 CpG 甲基化水平；B. 结直肠癌候选 Biomarkers 在临床样本中的 CpG 甲基化水平。
注：CRCA: Colorectal Cancer；Pt: Peritumoral tissue；Control 为人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1471)。样本起始投入量为 20 ng。

基因列表

目标癌种	甲基化候选基因
肺癌	BCAT1	CDH1	CDKN2A	CDO1	DMRTA2	FOXD3	FOXI2	GATA5	GDNF	HOXA7
	HOXA9	OPCML	PAX5	PTGER4	RASSF1	SCT	SHOX2	SIX6	SLC12A8	SOX17
	ST6GALNAC5	SULF2	TAC1	TNFRSF25	ZFP42
乳腺癌	APC	ASCL1	BRCA1	C1QL3	CPXM1	DKK3	GALR1	HOXA10	HOXA9	ITIH5
	LBX1	OTP	PITX2	RARB	RASGRF1	SOX1	USP44
结直肠癌*	ADHFE1	ALX4	ASCL1	BCAT1	BMP3	C1QL3	CNRIP1	EYA4	FBN1	FGF5
	IKZF1	INA	MAL	NDRG4	NPY	OPCML	RARB	SDC2	SEPTIN9	SFRP2
	SIX6	SNCA	SOX1	SPART	ST6GALNAC5	TAC1	TFPI2	TM6SF1	VAV3
前列腺癌	AKR1B1	ANXA2	AOX1	APC	CFAP90	GDAP1L1	GSTP1	HAAO	PRKCB	PTGS2
	RARB	RUNX3	SEPTIN9	SIX6	TAC1
胃癌	ADRA1B	ARHGAP20	ASCL1	C1QL3	CABIN1	CD40	CPEB1	DLGAP3	DOCK10	ELMO1
	HOPX	HOXD11	KCNQ5	LMX1A	RNF180	RORB	RPRM	RUBCNL	RUNX3	SDC2
	SEPTIN9	TCF4	TFPI2	ZNF569
肝癌	ALX3	ARHGEF33	C1QL3	CDKL2	CFTR	DCDC2	EVX1	FAR1	HOXA11	HOXA9
	MTHFD2	PLAC8	RIPK3	RUNX3	SEPTIN9	SGIP1	SH3YL1	SIX6	SOX1	TAMALIN
	TBX15	WNT3A	ZNF605
宫颈癌	ASCL1	ASTN1	C1QL3	CHAD	CHRM2	DLX1	EDN3	EPB41L3	FGF10	HOXA9
	ITGA4	ITGA8	JAM3	OPCML	PAX1	PCDHGB7	RXFP3	SEPTIN9	SIX6	SOX1
	SOX17	ST6GALNAC5	TAC1	TAFA4	TFPI2	ZNF582	ZNF781	ZSCAN1
膀胱癌	EOMES	FEZF2	HAND2	IRAK3	IRX4	LRRC4	NID2	NOVA1	NRN1	ONECUT2
	OTX1	PENK	PIGG	SOX1	TAC1	TCERG1L	TMEFF2	TWIST1	VIM
食管癌	ASCL1	CCNA1	EPO	HOXC10	HOXD1	KCNA3	MAFB	MT1A	MT1G	OPCML
	RAB37	RAPGEFL1	SEPTIN9	SIX6	ST3GAL6	ST6GALNAC5	TAMALIN	TFPI2	ZNF132	ZNF154
	ZNF582
卵巢癌	CDH13	CDO1	GYPC	HNF1B	HOXA11	HOXA9	IFFO1	LOC284798	LYPD5	OPCML
	PAX1	PCDH17	PCDHB18P	RASSF1	RYBP	SOX1	TAC1	ZNF671

*此外还覆盖了表中未列出的基因间区 (Intergenic，含 12 个 CpG 位点)。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。