μCaler® HotSpot Panel v1.0

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#1101402
#1101401

μCaler^® HotSpot Panel v1.0 靶向肿瘤突变“热点”区域，涉及致癌和肿瘤抑制相关的 49 个热点突变基因，探针覆盖基因组约 25 Kb 区域。

该 Panel 与 μCaler^® Hybrid Capture System 配套使用。基于全新的 μCaler^® 靶向富集系统， μCaler^® HotSpot Panel v1.0 提升了捕获效率，捕获表现稳定优异且大幅度减少了实验所需时间，实现更高效的测序并节省成本。

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基因列表

AKT1	ALK	APC	AR	ARAF	ATM	BRAF	CDKN2A	CHEK2	CTNNB1
DDR2	EGFR	ERBB2	ERBB3	ESR1	FBXW7	FGFR1	FGFR2	FGFR3	FGFR4
FLT3	GNA11	GNAQ	GNAS	HRAS	IDH1	IDH2	KIT	KRAS	MAP2K1
MAP2K2	MET	MTOR	NRAS	NTRK1	NTRK3	PDGFRA	PIK3CA	PTCH1	PTEN
RAF1	RET	ROS1	SF3B1	SMAD4	SMO	STK11	TP53	TSC1

产品表现

捕获表现

图 1. μCaler^® HotSpot Panel v1.0 的捕获表现。LDT OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience，LDT900) 利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行预文库构建； 500 ng/预文库投入，参照 μCaler^® 杂交捕获指南。利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，On-target 按照 reads 数计算。A. 捕获数据的中靶率、比对率及靶区域覆盖度；B. 靶区域覆盖均一性。
注：LDT OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience， LDT900) 包含阴性质控品 (LDT Bioscience，LDT898) 和阳性质控品 (LDT Bioscience，LDT899) 。测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150。

变异分析

图 2. μCaler^® HotSpot Panel v1.0 捕获数据中变异频率与标准品频率的一致性。利用 NadPrep^®快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 构建预文库，以 μCaler^® HotSpot Panel v1.0 完成杂交捕获，Vardict 1.5.1 进行变异分析。测序模式：Illumina Novaseq 6000，PE150。
注：样本为 OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience，LDT900) 。