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解决方案

NEXome Plus Panel v1.0

货号：

#1001862
#1001861

NEXome Plus Panel v1.0 是一款增强型全外显子捕获 Panel，在 NEXome Core Panel 的基础之上，增加了全基因组 SNP 骨架、实体瘤常见基因融合相关的内含子区域、经典微卫星位点等，覆盖人类基因组约 43.3 Mb 区域。

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全基因组 SNP 骨架

基于 1000 Genomes 数据库，侧重选择中国人群中高 MAF 值和高杂合率的位点 (> 9000 个) ，以约 300 Kb 的间隔覆盖整个人基因组，在全外显子组的基础上，提供更为丰富、分布更均匀的基因组组成状态信息，可用于 CNVs 和杂合性缺失检测。

实体瘤相关融合区域

包含常见融合相关的内含子区域和非编码区域，可用于分析实体瘤中的融合位点。

ALK

intron 18 - 19

BCL2

3'UTR

BCR

intron 8, 13 - 14

BRAF

intron 7 - 10

BRCA1

intron 2, 7 - 8, 12, 16, 19 - 20

BRCA2

intron 2

CD74

intron 6 - 8

EGFR

intron 7, 15, 24 - 27

ETV4

intron 5 - 6

ETV5

intron 6 - 7

ETV6

intron 5 - 6

EWSR1

intron 6 - 13

EZR

intron 9 - 12

FGFR1

intron 1, 5, 17

FGFR2

intron 1, 17

FGFR3

intron 17

FLI1

intron 3 - 8

KIT

intron 16

KMT2A

intron 6 - 11

MET

intron 1, 14

MSH2

intron 5

MYB

intron 14

MYC

intron 1

NOTCH2

intron 26

NTRK1

intron 8 - 10

NTRK2

intron 12, 15

NTRK3

intron 13 - 14

NUTM1

intron 1

PDGFB

intron 1

PDGFRA

intron 7, 9, 11

RAF1

intron 4 - 9

RARA

intron 2

RET

intron 7 - 11

ROS1

intron 31 - 35

RSPO2

Upstream, 5'UTR, exon 1 - 2, intron 1

SDC4

intron 2

SLC34A2

intron 4

TMPRSS2

intron 1 - 3

经典微卫星位点

NEXome Core Panel 本身覆盖大量的微卫星位点，15 个优化设计的 MSI 经典位点的加入有助于不同微卫星不稳定分析方法间的比较以及分析流程的优化和校正。

BAT-25

BAT-26

BAT-40

BAT-RII

NR-21

NR-22

NR-24

NR-27

MONO-27

D2S123

D5S346

D17S261

D17S520

D17S250

D18S34

产品表现

捕获表现

图 1. NEXome Plus Panel v1.0 在单杂和 12 杂情况下的捕获表现。利用 NadPrep^®DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina^®) 构建文库，以 NEXome Plus Panel v1.0 完成杂交捕获，测序模式为 Illumina HiSeq X Ten，PE150，利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，on-target 按照 reads 数计算。
注：样本为：人类男性基因组 DNA (Promega-Male, G1471) 和人类女性基因组 DNA (Promega-Female, G1521) 。

图 2. NEXome Plus Panel v1.0 对不同 gDNA 文库的捕获表现。利用 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina^®) 构建文库，以 NEXome Plus Panel v1.0 (12 plex) 完成杂交捕获，测序模式为 Illumina HiSeq X Ten，PE150，利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，on-target 按照 reads 数计算。 A. 捕获数据比对率和捕获效率；B. 靶区域覆盖度；C. 覆盖均一性和一致性；D. GC 偏好性。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。