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样本中的病原丰度各异,NEX-t Panel v1.0 使用时是否需要单独杂交捕获来保证获得相同的数据量?

浏览量:180 / 发布时间:2023-09-08

由于不同样本中的病原含量差异较大,如果希望每个样本都获得相似的数据量,则无法混合杂交,只能单独杂交。不过如下图所示,当样本中微生物含量存在数量级的差异时,虽然数据量差异较大,但是对于低丰度的样本,其本身所需的数据量也相对较低。同时,不同样本之间由于使用相同的实验参数,具有相似的 PCR 重复率。如果将它们分别杂交捕获,并设置相同的测序量,则低丰度样本需要增加 PCR 循环数,相同的信息量只会以重复的形式组成提升的测序数据量,这是因为 Panel 捕获后测序更容易达到饱和。因此,对于具有相似来源的样本,我们建议是可以进行混合杂交的。

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