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湿实验“躺平”技巧—— NadAuto-96R 高通量自动化样本制备系统应用实战

浏览量:4346 / 发布时间:2023-08-14

01 背景

靶向捕获测序在肿瘤、遗传病等领域的应用日益广泛,但实验流程耗时长、操作繁琐一直是稳定产出的困扰之一。通过自动化工作站引入标准化操作流程,既能大幅提升样本处理通量,也能减少手工操作带来的批间差异。同时,人工干涉的减少也能显著降低出错概率,并节省人力成本。

表 1. 自动化工作站与手工操作对比*

本文中,纳昂达分享如何充分利用高通量自动化样本制备系统 (NadAuto-96R) 及配套试剂和脚本,实现每周 672 和 384 个样本的自动化靶向捕获实验,作为实验室自动化平台应用的示例参考。

注:*上述两种人机搭配方案,均基于纳昂达生物推出的 MGI 平台文库构建试剂 (NadPrep®️ 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 等) 和杂交捕获试剂 (NanOnco Plus v3.0 等) 优化而来。当应用于其它 Panel 捕获方案或 Illumina 平台时,需进行必要的调整。


图 1. NadAuto-96R 自动化靶向捕获流程概览

注:初始样本为已完成提取、定量且质检合格的 DNA

02 七日极致周期方案

适用于高通量、工作时间灵活、追求高度自动化及极致周期的场景。在 7 天周期中,每日可完成 96 个预文库构建以及相应的杂交捕获实验,全程最少仅需 1 人。为充分利用过夜时间,杂交时长设置为 10 小时并分配在 21 点至次日 7 点。