随着基因测序相关技术的持续革新和应用领域的深入发展,行业竞争格局也在不断演化。MGI 平台测序仪在稳定产出高质量测序数据同时,相对于 Illumina 平台的重复率更低,Index hopping 问题也得到极大缓解。华大智造推出的 MGIEasy 通用文库转换试剂盒(App-A)可将 Illumina 平台文库转换成单链环状文库,并实现在 MGI 平台测序。然而这种方式需要额外增加 5-10 个循环的 PCR 扩增,引入扩增累积错误,并导致 MGI 平台的低数据冗余率优势被抹去。此外,Illumina 平台文库多为双端 8 nt Index,转化测序的读取也存在一定的不兼容。
纳昂达科技即将推出 NadPrep®️ Universal UDI Adapter Module 系列接头模块,其全新设计的双端唯一 10 nt Index,不但可用于 Illumina 平台 8 nt 或 10 nt Index 读取模式,也可兼容 MGI 平台测序。当用于 MGI 平台时,构建的文库可直接环化后测序,无需转化。
设计方式
优化设计的 NadPrep®️ Universal UDI Adapter Module为双端唯一的 10 nt Index (barcode),既符合 Illumina 平台 8 碱基 4 Index 最小色彩平衡,又同时符合 MGI 平台 10 碱基 4 Index 最小色彩平衡,且已在双平台验证。
图 1 | NadPrep®️ Universal UDI Adapter Module 由通用截短型接头和 UDI Indexing Primer 组成。
产品表现
·均一的文库和数据产出
图 2 | NadPrep®️ Universal UDI Adapter Module 应用示例。
A. 96 个 Universal UDI Adapter 构建文库的产量。50 ng 片段化gDNA,按 NadPrep® DNA Library Preparation Module (for Illumina®) 说明书操作,分别使用 Index 1-96,扩增 5 个循环,平均文库产出均 > 500 ng;B. 96 个 Universal UDI Adapter 构建文库分别在 Illumina 平台和 MGI 平台的有效拆分率。
测序模式:MGISEQ-2000,PE150;Novaseq 6000,PE150。
·有效提升数据准确度
图 3 | 数据串扰分析。96 个 Universal UDI Adapter 构建的 WGS 文库,混合后单条 lane 测序。测序模式:MGISEQ-2000,PE150。
注:绿色代表 perfectmatch 配对 barcode % > 98.5%。
NadPrep®️ Universal UDI Adapter Module 已可申请试用,请联系当地销售或 sales@njnad.com。
关于纳昂达科技
Nanodigmbio
纳昂达科技 成立于 2011 年,秉承 “Nano Trans More ”的核心理念和 “靶向精准,用心服务诊断”的奋斗宗旨,致力于为科研院校、医疗机构、临检单位、产业公司、测序服务商等提供专业化和高质量的靶向测序产品与闭环解决方案。
公司深耕精准靶向领域,目前拥有 MGI 和 Illumina 双测序平台多款文库构建试剂盒和全套液相杂交试剂产品。明星产品还包括全外显子 Panel、泛实体瘤和血液肿瘤 Panel 以及呼吸道病毒 Panel 等,并提供全面完善的双平台捕获探针定制化服务。
面积 > 2,000 平米的高通量测序研发中心和 > 2,500平米的GMP级别(YY/T0287-2017idt ISO13485:2016)体外诊断试剂生产基地为产品创新与生产质量保驾护航。纳昂达的销售网络覆盖全国并已外延至海外地区。
公司将与客户共成长,对客户的需求全力以赴,为全球用户提供靶向测序解决方案和 IVD 试剂原料。