新品速递 | 三合一通用环化来了！

MGI 平台测序在上机前需要对文库进行预操作，以原始的单链环状 DNA（Single-stranded Circular DNA, ssCirDNA）为模板，进行滚环式复制形成 DNA 纳米球（DNA Nano Ball，DNB）后加载至测序载片上。华大智造推出的高通量测序试剂套装包括单 barcode、双 barcode 以及 App-A 测序试剂。由于不同类型样本标签接头结构的差异，需要使用多达 3 种不同的环化方案来制备 ssCirDNA。为了提高操作的便利性，纳昂达科技在 2021 年推出通用环化试剂盒（NadPrep^® Universal Circularization Kit），可以同时满足 MGI 平台单标签（Single Index，SI）和双标签（Dual Index, DI）两种接头类型的文库。

NadPrep^® Universal Circularization Kit v2 可以同时兼容 MGI 平台 SI 、DI 类型文库和 Illumina 平台通用接头文库的环化，更易于用户操作。升级后的 v2 版本，进一步提升了环化效率，同时也将整个环化流程缩短至~1 小时，减少了 MGI 测序前准备时间。

图1. NadPrep^® Universal Circularization Kit v2 支持的文库类型

* NadPrep^® Universal Stubby Adapter (UDI) 接头类型文库或经过 MGIEasy 通用文库转换试剂盒 (App-A) 转换文库。

NadPrep^® 通用环化试剂盒 v2 升级后兼容更多类型接头文库的环化，例如纳昂达 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒分别搭配 NadPrep^® Universal Adapter (SI) Module (for MGI) 和 NadPrep^® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建的 MGI 平台 SI 和 DI 类型接头的文库；搭配 NadPrep^® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 构建的 Illumina 通用接头类型文库。在全面兼容文库类型的同时，无需调整实验流程，这无疑极大降低了操作的复杂度，也缩短了多种类型文库的环化时间。它的环化效率也远优于竞品，且并未牺牲任何的测序质量（图2）。

图 2. 不同类型接头文库的环化效率和测序质控表现。A. 环化效率，B. Q30 和 C. 比对率。

注：样本为人类女性基因组 DNA (Promega-Female, G1521)，投入量为 1 pmol。

面对多元化的测序应用场景，文库构建流程也变得复杂多样。但无论是面对不同类型的样本（如 RNA、gDNA、FFPE DNA、甲基化 DNA）、长度多变的插入片段（180-380 bp）以及不同文库投入量（0.1-2 pmol）时，NadPrep^® 通用环化试剂盒 v2 均能以稳定高效的环化效率，实现多场景的高度兼容。

图 3. 不同类型、长度和投入量时的环化表现。A. 不同类型文库，B. 不同长度插入片段和 C. 不同投入量文库的环化效率表现。

平均 GC 含量在 33%~66% 不等的微生物样本文库，使用不同环化方案后的测序结果显示，NadPrep^® 通用环化试剂盒 v2 与竞品 Vendor M* 表现一致，无明显 GC 偏好性。

图 4. NadPrep^® 通用环化试剂盒 v2 对宏基因组样本的环化表现。A. 绿脓杆菌，B. 肠沙门氏菌和 C. 金黄色葡萄球菌。